分子植物育種期刊影響因子為：0.85。
分子植物育種雜志國內刊號為：46-1068/S，目前被北大期刊(中國人文社會科學期刊)、統計源期刊(中國科技論文優秀期刊)、知網收錄(中)、維普收錄(中)、萬方收錄(中)、CA 化學文摘(美)、JST 日本科學技術振興機構數據庫(日)、國家圖書館館藏、上海圖書館館藏等收錄，獲得過中國優秀期刊遴選數據庫、中國期刊全文數據庫（CJFD）、中國科技期刊優秀期刊、北大圖書館收錄期刊等榮譽。
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